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BioOptix™ 10
Table of Contents
ix
List of Figures
1-1 BioOptix 10 front panel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-3
1-2 BioOptix 10 left-side connections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-4
1-3 BioOptix 10 right-side connections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-5
1-4 BioOptix 10 rear panel controls and connections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-6
2-1 System space requirements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-2
2-2 Accessing pump and column module internal connections . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-3
2-3 Removing the column module back plate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-3
2-4 Routing the Sample Out lines (column module) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-4
2-5 Pump controller connection . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-4
2-6 P110 Connection on BD3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-5
2-7 J106 Connection on BD1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-5
2-8 AC power connection from pump module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-6
2-9 Ribbon cable connections
(top half of column module shown) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-6
2-10 Liquid connections
(pump module shown) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-7
2-11 Aligning the fasteners . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-8
2-12 Column clamps inserted . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-8
2-13 Foxy arm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-9
2-14 Buffer assembly routes a common solution to all ten channels . . . . . . . . . . . . . 2-11
2-15 Buffer assemblies installed . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-11
2-16 Foxy 200 tubing connections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-13
2-17 Adhesive retainers attached . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-13
2-18 Column bypass tubing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-16
2-19 Mode control knob . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-16
2-20 BioOptix 10 Manual Hardware Control window . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-17
3-1 Gradient File . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-2
3-2 Equilibrate tab settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-4
3-3 Load tab settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-5
3-4 Wash tab settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-6
3-5 Elute tab settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-6
3-6 Flush tab settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-7
3-7 Experiment File . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-8
3-8 BioOptix 10 Operation Buttons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-9
3-9 Pause at end of block . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-10
3-10 Pump flush option . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-11
3-11 Flush window . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-11
4-1 Flush window . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-1
4-2 Access the pump assembly . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-3
4-3 Pump assembly components . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-4
4-4 Attach seal to push rod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-4
4-5 Waste port mounting plate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-6
4-6 Deuterium lamp location . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-6
4-7 Circuit breaker location . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-9
4-8 Thermal breaker location . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4-9
A-1 Installed Standard.tpl file . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A-2
A-2 Customizable values in the Standard.tpl file . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A-3
B-1 Fluid path for Fluid-type blocks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . B-1
B-2 Inactive channel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . B-2
B-3 Fluid path for Load-type blocks -
Pump injections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . B-2
B-4 Fluid path for Load-type blocks -
Manual injections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . B-3
B-5 Fluid path for Gradient-type blocks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . B-3
B-6 Pump flush . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . B-4
B-7 BioOptix 10 Plumbing Diagram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . B-5